Le monde a bien changé depuis l'arrivé du puissant Mewtwo. Étant le pokémon le plus froid et sans coeur mais aussi le plus près de l'être humain, il créa une une organisation après avoir détruit le laboratoire de son créateur; soit le Culte. Le Culte a pour but de détruire l'humanité pour créer un monde contrôlé par des pokémons. Mais, ce n'est pas tout. Mewtwo enchaine ou pire, enlève la vie aux pokémons qu'il considère rebelles. D'après lui, le monde est bien meilleur et en ordre sous l'autorité d'un seul maître.

Pour se débarrasser des humains, il transforme ceux-ci en pokémon et les oblige à devenir Cultiste sinon la mort les attends. Mais, d'un autre côté, un organisation de pokémon dénommé tout simplement "La Guilde de Milotic" contre-attaque le Culte en protégeant les innocents. Dans quel camps serez-vous? Enfin, si vous êtes un pokémon ou... un humain dans le corps d'une de ses créatures.

D'un autre côté, la Team Rocket veut se venger de Mewtwo et désire, encore, contrôler le monde et posséder tous les pokémons les plus puissants. Mais, il existe encore la voix classique; celle du dresseur, du coordinateur, du ranger ou de l'éleveur tout à fait normal qui cherche à accomplir ses buts personnels. Où serez vous dans POKÉMON FREEDOM ??

Informations : Vous commencerez votre aventure là où vous voudrez et vous aurez le premier pokémon qu'il vous faut. Vous pouvez incarner des personnages connus si vous le voulez et les reprendre à partir du début de la série car c'est au début de la saison 1 que commence notre aventure. Vous pouvez même les faire évoluer différemment. Nous vous encourageons toute de même à créer votre personnage pour que ça fasse un peu plus original.